Question 1

Kostenlose Codonoptimierung

Accepted Answer

ProteoGenix hat einen einmaligen Algorithmus zur Codonoptimierung auf Basis experimenteller Daten entwickelt.
Viele Aminosäuren werden durch mehrere Codons verschlüsselt, sogenannte synonyme Codons. Bestimmte Codons werden bei der Genübersetzung jedoch häufiger verwendet (codon usage bias), das artspezifisch ist. Daher können seltene Codons durch häufigere Codons ersetzt werden, ohne die Aminosäuresequenz zu verändern. Das Codonoptimierungs-Tool von ProteoGenix nutzt diese Strategie und weitere Parameter wie GC-Gehalt, Wiederholungssequenzen, Vermeidung von Restriktionsschnittstellen und mRNA-Sekundärstruktur.
Anwendungen der Codonoptimierung:

Vereinfachte DNA-Synthese: Das kostenlose Codonoptimierungs-Tool von ProteoGenix verbessert Effizienz und Design individuell angepasster Gene, unter Berücksichtigung natürlicher Codon-Biases und Synthese-Komplexität.
Rekombinante Proteinproduktion in diversen Expressionssystemen: Codonoptimierung ist essentiell für eine einfache Subklonierung und verbesserte Expression sowie Ausbeute. Die heterologe Expression ist zentral in moderner Biotechnologie und Biomedizin.
Gentherapie: Hier wird Codonoptimierung genutzt, um u.a. Duchenne-Muskeldystrophie (Athanasopoulos, T et al, 2011) und Hepatitis C (Frelin L et al, 2004) zu behandeln.
Genetische Immunisierung: Ein Immunantwort kann durch direkte Injektion des Gens, das das Antigen codiert, erzeugt werden. DNA-Impfstoffe sind besonders hilfreich, wenn ein Protein schwierig zu exprimieren oder zu reinigen ist. Studien zeigen, dass optimierte Gene höhere Immunantworten hervorrufen als Wildtypgene (Stratford et al., 2000; Uchijima et al., 1998). Die Einbindung von CpG-Inseln verstärkt die Immunogenität nochmals (Krieg et al., 1998). Individuelle DNA-Synthese und Genassembly bieten hierbei große Vorteile.

Question 2

Gensubklonierung in einen unserer Vektoren oder in Ihren eigenen

Accepted Answer

Gensubklonierung in einen unserer Vektoren oder direkt in Ihren eigenen Vektor

Question 3

Ortsgerichtete Mutagenese von jeder bereitgestellten Vorlage

Accepted Answer

Ortsgerichtete Mutagenese von jeder vorhandenen Vorlage möglich

Question 4

Genvariantenbibliotheken mit gezielten Änderungen an einer oder mehreren Positionen

Accepted Answer

ProteoGenix bietet Genvariant-Bibliotheken mit Veränderungen an einer oder mehreren Positionen zur Optimierung der Proteinexpression. Besonders nützlich für High-Throughput-Screenings, etwa beim Protein-Engineering.

Question 5

Endotoxinfreie Plasmid-Präparation

Accepted Answer

Als Spezialist für Gensynthese bietet ProteoGenix Ihnen auch endotoxinfreie Plasmid-Amplifikation. Nach der Genoptimierung und Klonierung ist dieser Schritt wichtig, um ausreichend endotoxinfreies Plasmid für Ihre Experimente bereitzustellen.

Question 6

V 2015

Accepted Answer

Bicc1 Polymerization Regulates the Localization and Silencing of Bound mRNA Benjamin Rothé,a Lucia Leal-Esteban,a Florian Bernet,a Séverine Urfer,a Nicholas Doerr,b Thomas Weimbs,b Justyna Iwaszkiewicz,c and Daniel B. Constama
Fine Mapping and Characterization of the L-Polymerase-Binding Domain of the Respiratory Syncytial Virus Phosphoprotein Julien Sourimant,a,c Marie-Anne Rameix-Welti,a,c,d Anne-Laure Gaillard,a Didier Chevret,b Marie Galloux,a Elyanne Gault,c,d and Jean-François Eléouëta

Question 7

V 2014

Accepted Answer

Matthias Canault,1,2,3 Dorsaf Ghalloussi,1,2,3 Charlotte Grosdidier,1,2,3 Marie Guinier,4 Claire Perret,5,6,7 Nadjim Chelghoum,4 Marine Germain,5,6,7 Hana Raslova,8 Franck Peiretti,1,2,3 Pierre E. Morange,1,2,3 Noemie Saut,1,2,3 Xavier Pillois,9,10 Alan T. Nurden,10 François Cambien,5,6,7 Anne Pierres,3,11,12 Timo K. van den Berg,13 Taco W. Kuijpers,13 Marie-Christine Alessi,1,2,3 and David-Alexandre Tregouet5,6,7. Interaction of a Partially Disordered Antisigma Factor with Its Partner, the Signaling Domain of the TonB-Dependent Transporter HasR.
Idir Malki,1,2,3 Catherine Simenel,1,2 Halina Wojtowicz,1,2 Gisele Cardoso de Amorim,1,2 Ada Prochnicka-Chalufour,1,2 Sylviane Hoos,4 Bertrand Raynal,4 Patrick England,4 Alain Chaffotte,1,2 Muriel Delepierre,1,2 Philippe Delepelaire,5 and Nadia Izadi-Pruneyre1,2. Kinetics of nif Gene Expression in a Nitrogen-Fixing Bacterium.
César Poza-Carrión, Emilio Jiménez-Vicente, Mónica Navarro-Rodríguez, Carlos Echavarri-Erasun, and Luis M. Rubio. Bacterial cytoplasm as an effective cell compartment for producing functional VHH-based affinity reagents and Camelidae IgG-like recombinant antibodies
Selma Djender, Aurelie Schneider, Anne Beugnet, Ronan Crepin, Klervi Even Desrumeaux, Chiara Romani, Sandrine Moutel, Franck Perez, and Ario de Marco

Question 8

V 2013

Accepted Answer

Davita Pillay,1,* Julien Izotte,1 Regassa Fikru,2,3,4 Philipe Büscher,3 Hermogenes Mucache,5 Luis Neves,5 Alain Boulangé,5,7 Momar Talla Seck,6 Jérémy Bouyer,6,7,8Grant B. Napier,9 Cyrille Chevtzoff,10 Virginie Coustou,1 and Théo Baltz1. α-Catenin and Vinculin Cooperate to Promote High E-cadherin-based Adhesion Strength.
William A. Thomas,a,b Cécile Boscher,c,d,1 Yeh-Shiu Chu,e,2 Damien Cuvelier,f Clara Martinez-Rico,b Rima Seddiki,c,d,g Julie Heysch,b Benoit Ladoux,g,h Jean Paul Thiery,e,h,i,j,3 René-Marc Mege,c,d,3 and Sylvie Dufourb,3,4

Question 9

V 2011

Accepted Answer

Recognition of Multivalent Histone States Associated with Heterochromatin by UHRF1 Protein
Nataliya Nady, Alexander Lemak,,1 John R. Walker,,1 George V. Avvakumov,,1 Michael S. Kareta,,1 Mayada Achour, Sheng Xue, Shili Duan, Abdellah Allali-Hassani, Xiaobing Zuo, Yun-Xing Wang, Christian Bronner, Frédéric Chédin, Cheryl H. Arrowsmith,,2 and Sirano Dhe-Paganon

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