Question 1

Optimisation des codons gratuite

Accepted Answer

ProteoGenix a développé un algorithme unique d’optimisation des codons, basé sur des données expérimentales.
La majorité des acides aminés sont encodés par plusieurs codons dits synonymes. Cependant, certains codons sont utilisés plus fréquemment que d’autres lors de la traduction : ce phénomène, appelé biais d’usage des codons, est spécifique à chaque espèce. Grâce à la redondance du code génétique, les codons rares peuvent être remplacés par des codons plus courants dans l’hôte sans modifier la séquence de la protéine. L’outil d’optimisation de ProteoGenix applique une stratégie biais d’usage et d’autres paramètres : %GC, séquences répétées, évitement des sites de restriction, structure secondaire ARN messager.
Applications de l’optimisation des codons :

Faciliter la synthèse d’ADN : l’outil gratuit de ProteoGenix, prenant en compte le biais naturel et la complexité de la synthèse, optimise efficacement la conception de gènes synthétiques sur mesure.
Production de protéines recombinantes dans divers systèmes d’expression : l’optimisation des codons facilite le sous-clonage et améliore l’expression et le rendement du gène. L’expression hétérologue est clé en biotechnologie et biomédecine.
Thérapie génique : l’optimisation des codons aide au traitement de plusieurs maladies, comme la dystrophie musculaire de Duchenne (Athanasopoulos, T et al, 2011) et l’Hépatite C (Frelin L et al, 2004).
Immunisation génétique : une réponse immunitaire peut être obtenue en injectant le gène de l’antigène. Ainsi, l’ADN vaccin est idéal quand la protéine est difficile à exprimer/purifier. Les gènes natifs génèrent moins de réponse immunitaire que les gènes optimisés (Stratford et al, 2000 ; Uchijima et al, 1998). Les adjuvants augmentent la réponse pour les vaccins protéiques, mais pas pour les ADN vaccins, d’où la performance moindre de ces derniers sur de grands animaux. L’ajout d’îlots CpG dans les vaccins ADN améliore l&#8217;immunogénicité (Krieg et al., 1998). Ainsi, la synthèse sur mesure d’ADN et l’assemblage génique apportent une réelle valeur ajoutée.

Question 2

Sous-clonage dans l’un de nos vecteurs ou directement dans le vôtre

Accepted Answer

Sous-clonage dans l’un de nos vecteurs ou directement dans le vôtre

Question 3

Mutagenèse dirigée à partir de tout template fourni

Accepted Answer

Mutagenèse dirigée à partir de tout template fourni

Question 4

Bibliothèques de variants géniques avec modifications spécifiques

Accepted Answer

ProteoGenix peut fournir des bibliothèques de variants géniques, avec modifications ciblées en un ou plusieurs points pour optimiser l’expression protéique. Service idéal pour le criblage haut débit en ingénierie des protéines (ex : modification d’AA sur sites définis).

Question 5

Préparation de plasmide sans endotoxine

Accepted Answer

En tant que fabricant leader dans le service de synthèse de gènes à façon, ProteoGenix propose également l’amplification de plasmides sans endotoxine. Après optimisation et clonage, il est souvent nécessaire d’amplifier la construction pour disposer de plasmide sans endotoxine en quantité suffisante pour les expériences.

Question 6

V 2015

Accepted Answer

Bicc1 Polymerization Regulates the Localization and Silencing of Bound mRNA Benjamin Rothé,a Lucia Leal-Esteban,a Florian Bernet,a Séverine Urfer,a Nicholas Doerr,b Thomas Weimbs,b Justyna Iwaszkiewicz,c and Daniel B. Constama
Fine Mapping and Characterization of the L-Polymerase-Binding Domain of the Respiratory Syncytial Virus Phosphoprotein Julien Sourimant,a,c Marie-Anne Rameix-Welti,a,c,d Anne-Laure Gaillard,a Didier Chevret,b Marie Galloux,a Elyanne Gault,c,d and Jean-François Eléouëta

Question 7

V 2014

Accepted Answer

Matthias Canault,1,2,3 Dorsaf Ghalloussi,1,2,3 Charlotte Grosdidier,1,2,3 Marie Guinier,4 Claire Perret,5,6,7 Nadjim Chelghoum,4 Marine Germain,5,6,7 Hana Raslova,8 Franck Peiretti,1,2,3 Pierre E. Morange,1,2,3 Noemie Saut,1,2,3 Xavier Pillois,9,10 Alan T. Nurden,10 François Cambien,5,6,7 Anne Pierres,3,11,12 Timo K. van den Berg,13 Taco W. Kuijpers,13 Marie-Christine Alessi,1,2,3 and David-Alexandre Tregouet5,6,7. Interaction of a Partially Disordered Antisigma Factor with Its Partner, the Signaling Domain of the TonB-Dependent Transporter HasR.
Idir Malki,1,2,3 Catherine Simenel,1,2 Halina Wojtowicz,1,2 Gisele Cardoso de Amorim,1,2 Ada Prochnicka-Chalufour,1,2 Sylviane Hoos,4 Bertrand Raynal,4 Patrick England,4 Alain Chaffotte,1,2 Muriel Delepierre,1,2 Philippe Delepelaire,5 and Nadia Izadi-Pruneyre1,2. Kinetics of nif Gene Expression in a Nitrogen-Fixing Bacterium.
César Poza-Carrión, Emilio Jiménez-Vicente, Mónica Navarro-Rodríguez, Carlos Echavarri-Erasun, and Luis M. Rubio. Bacterial cytoplasm as an effective cell compartment for producing functional VHH-based affinity reagents and Camelidae IgG-like recombinant antibodies
Selma Djender, Aurelie Schneider, Anne Beugnet, Ronan Crepin, Klervi Even Desrumeaux, Chiara Romani, Sandrine Moutel, Franck Perez, and Ario de Marco

Question 8

V 2013

Accepted Answer

Davita Pillay,1,* Julien Izotte,1 Regassa Fikru,2,3,4 Philipe Büscher,3 Hermogenes Mucache,5 Luis Neves,5 Alain Boulangé,5,7 Momar Talla Seck,6 Jérémy Bouyer,6,7,8Grant B. Napier,9 Cyrille Chevtzoff,10 Virginie Coustou,1 and Théo Baltz1. α-Catenin and Vinculin Cooperate to Promote High E-cadherin-based Adhesion Strength.
William A. Thomas,a,b Cécile Boscher,c,d,1 Yeh-Shiu Chu,e,2 Damien Cuvelier,f Clara Martinez-Rico,b Rima Seddiki,c,d,g Julie Heysch,b Benoit Ladoux,g,h Jean Paul Thiery,e,h,i,j,3 René-Marc Mege,c,d,3 and Sylvie Dufourb,3,4

Question 9

V 2011

Accepted Answer

Recognition of Multivalent Histone States Associated with Heterochromatin by UHRF1 Protein
Nataliya Nady, Alexander Lemak,,1 John R. Walker,,1 George V. Avvakumov,,1 Michael S. Kareta,,1 Mayada Achour, Sheng Xue, Shili Duan, Abdellah Allali-Hassani, Xiaobing Zuo, Yun-Xing Wang, Christian Bronner, Frédéric Chédin, Cheryl H. Arrowsmith,,2 and Sirano Dhe-Paganon

Service de synthèse de gènes à façon

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